中校立刻就想到了一个可能性，控制潜艇的人想要攻击美军基地，应该是给他们一个教训。虽然有着这样的猜测，可是他却不能将这里的事情汇报上去，他的心情可想而知。要知道他和他的士兵虽然都是美国人，可是他们的潜艇却是俄罗斯的。如果攻击真的发生了，他们将会面临来自自己人的打击。而且还没有办法解释，这样的事情太过匪夷所思了，可是却实实在在地发生在他们的身上。这也从侧面证明的强大，掌握着如此先进的计算机技术的从这个方面来说已经足以立于不败之地，除非是远程打击，不过，话又说回来了，远程打击真的可以吗？
中校并没有将自己的猜测说出来，他知道说出来的话，肯定会引起骚乱的。虽然现在，他们已经失去了对潜艇的*控，可暂时还没有生命危险。一旦攻击美军基地，他们和这艘潜艇一样必将被消灭。被自己人消灭的感觉可不好。
虽然某些士兵也有了类似的猜测，可是长官不说话，他们也不敢说话。基斯等人也有了相同的推断，可他们都没有说出来。作为觉醒的异能者和基因战士，他们都有着强大的力量，如果潜艇被摧毁的话，他们可以提前离开。不过，他们离开的方式比较粗暴，是以破坏潜艇为代价的。那样的话，潜艇上的人都必死无疑。因此，他们一直在等机会，如果潜艇最终没事了，他们也不会动手破坏。
事实证明，中校的猜测是正确的，急速前进的潜艇很快就到了冲绳美军基地附近。在此期间，中校和他的手下，还有基斯他们都已经想尽了办法，甚至关闭了主计算机，最终都没能夺回潜艇的控制权。在此期间，中校也请求基斯和他的手下帮忙，可是他们除了战斗之外，别的几乎是一窍不通。他们是接受过训练，可是却没有潜艇这一项。虽然基斯等人已经做出了紧急时刻摧毁潜艇的某一部位，然后逃离潜艇，可是，作为武器存在的潜艇可不是这么容易被破坏的，更别说是从内部。潜艇的材质本身就非常坚固，何况，外面还有强大的水压。而且，他们已经失去了潜艇的控制权。因此，他们只能眼睁睁地看着潜艇朝着美军基地急速前进。作为一个军人，这样的感觉非常让他们难受，这个时候，所有人都向往陆地，如果他们的双脚站在大地之上，他们就可以做很多事情。可是，他们现在却是被困在这个狭长的潜艇里。
在距离冲绳美军基地只有三四海里的时候，潜艇的武器系统自行运转起来，四枚鱼雷被自动装进了发射舱。中校猜到主脑的目的之后，就试图破坏掉潜艇的武器系统，可是他的努力白费了。前往鱼雷舱的门被锁死了，强行突破的话，会造成不可挽救的后果，这可是在深海里。
其实，他们的潜艇靠近军事基地的时候，就已经被发现了。他们也做出了相应的警戒，虽然他们都知道这是一艘俄罗斯的主战潜艇，可是他们并没有主动发起攻击。他们可不想引起战争，更何况，美国的军舰也时常偷偷地到俄罗斯边境逛逛。也有别发现的时候，不过，谁也没有说出来。说出来的话，就意味着双方必将撕破脸，战争就变得不可避免。谁也承受不起战争带来的后果。因此，他们都保持了相对的克制。这一次，也是一样。不过，很快他们就目瞪口呆起来，因为他们看到那艘潜艇竟然释放出了四枚鱼雷。虽然他们已经做了相应的警戒，可是他们却没有做好战斗准备。不过，他们毕竟是训练有素的士兵，立刻就做出了反应。下令释放鱼雷进行拦截，可是军事基地周围的潜艇中，鱼雷并没有装上，也就是说他们并没有处于战斗状态。因为这里是美军基地，他们的潜意识里认为根本不可能有人会攻击这里。因此，虽然他们的反应很迅速，可还是没能及时地拦截鱼雷。以至于四枚鱼雷全都集中了停泊在港口的一艘护卫舰之上，爆炸之后，军舰就燃起了熊熊的大火，同时，军舰开始缓慢下沉。这个时候，不断有士兵从军舰跳进海里，随即朝着岸边拼命地游着。军舰正在下沉，如果等军舰彻底沉下去的时候，再跳可就来不及了，军舰下沉造成的巨大漩涡肯定会将他们吞噬的。好在这里是基地，军舰上并没有多少人。连续四声剧烈的爆炸惊动了所有人。基地上空立刻响起了刺耳的警报声，原本感觉无聊的士兵们立刻朝着自己的作战单位跑去，他们的反应展现了良好的军事素质。就在这个时候，又是四枚鱼雷朝着港口停泊的舰船冲了过来。这是潜艇上最后四枚鱼雷了，毕竟不是准备战斗，潜艇上携带的八枚鱼雷只是为了自卫。第二波鱼雷的攻击目标依旧是一艘护卫舰，主脑之所以没有选择战列舰或者航母，是因为这两种军舰太大了，潜艇上的水雷根本就不足以将其击沉。